玻尿酸微整注射屬於安全治療，免去不少侵入性手術的麻醉、恢復期與感染的風險，但是任何療程還是有一定的風險，除了慎選診所不要貪小便宜而打到來路不名的假貨與水貨以外，事前和醫師做仔細而詳實的諮詢溝通，以評估自身條件來達到預期的效果。當然，醫師的施打技術專業度和美感也很重要，玻尿酸注射要注意每個部位有不同的使用量和施打的深淺，有的患者因為注射到血管內，造成血管阻塞形成腫脹，這些不可不慎。
一般注射合法的成分經過測試 過敏的機率極低，不過在做療程前務必了解微整形注射可能帶來的風險，以下將其副作用與風險一一列出：
1. 注射部位局部發紅、腫脹：這屬於暫時性的正常現象，一般在幾天內就會消失，假如長久未消，請務必到醫院做檢查。
2. 局部瘀青：假如在注射玻尿酸時，針頭若碰到細小的毛細血管，就會出現皮下瘀血（瘀青）的現象，瘀青通常會在1至2週內慢慢消失，請不用擔心。
3. 色素沉著：一般情況下，注射位置過淺或是在療程後沒有注意防曬，可能會發生色素沉著的現象。
4. 感染：極少出現，造成的原因可能是術中清潔不到位或是術後護理不當，一旦發生感染，要及時至醫院複診以盡快處理。
5. 皮膚凹凸不平、有團塊：若注射深度過於淺表，臨床上可能會出現肌膚凹凸不平、有團塊的現象。
6. 血管栓塞：尤其打鼻子與山根要注意，此區的血管密布，假如醫師經驗不足，有可能將玻尿酸打到血管中造成栓塞，血液氧氣供應不足導致皮膚壞死。
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